В 1795-1797 годах на углу ул. Дворянская (позже - Петропавловская) и Сибирская по проекту губернского архитектора П.Т.Васильева было построено оригинальное двухэтажное каменное здание с большим куполом и красивым балконом для главного народного училища,которое в 1808 году переименовали в гимназию. Фасад дома выходил на Дворянскую улицу, в нижнем этаже располагались квартиры директора и учителей. Угловая часть здания была закруглена; здесь помещался двусветный актовый зал. Во флигеле на Сибирской улице были библиотека, и минералогический и физический кабинеты.
    Первым директором гимназии стал Никита Саввич Попов, автор двухтомной книги «Хозяйственное описание Пермской губернии»- первого подобного рода труда в России. В 1820-х годах учителем логики и риторики был замечательный поэт- сатирик Василий Тихонович Феонов. Его произведения печатались в журналах «Заволжский муравей», «Вестник Европы»; многие стихи не увидели свет, так как рукописи сгорели в пожаре 1842-ого года.
    Пожар 1842-ого года уничтожил и само творение архитектора Васильева- здание гимназии. Пока строилось новое двухэтажное каменное здание на Петропавловской, 26, занятия проходили в клубе Благородного собрания. В 1851 году строительство было завершено. Парадный вход в гимназию находился теперь со стороны Сибирской улицы.
Директором гимназии с 1844 по 1884 год был Иван Флорович Грацинский (1800-1887).
    В 1871 году мужская гимназия была преобразована в классическую мужскую гимназию имени императора Александра Первого, с преподаванием двух древних языков. В ней открылся подготовительный класс и появился институт классных наставников. Впервые в 1872 году были введены двойные экзамены - письменные и устные, и из 20-ти человек их выдержали 10. В следующем году был открыт 8-ой класс с педагогическим курсом.
   В сентябре 1886 года гимназия отметила 100-летие со дня открытия главного народного училища, из которого она вышла.
   При директоре Якове Ивановиче Алфионове в 1896 году заложили 3-ье здание гимназии, которое соединило между собой первые два. Было оно построено для квартиры директора, канцелярии, архива, приёмной врача и библиотеки Дмитрия Дмитриевича Смышляева, которую тот подарил гимназии в 1867 году.
    21 сентября 1908 года Пермская классическая гимназия торжественно отпраздновала своё 100-летие.
    В 1919 году в Перми открылся рабфак. В 1932 году место рабфака занял выделившийся из университета медицинский факультет; это был главный корпус мединститута ( сейчас- корпус №1 Пермской Медицинской Академии).